故事讲述地球遭遇毁灭性瘟疫，一艘星际方舟载着人类逃离，却受到了新的威胁攻击——一种变形的外星力量出现要灭绝人类！。该剧主要讲述了1950年，国民党特务勾结日本遗留特务，妄图用细菌武器对新生共和国政权进行破坏，共和国卫士最终粉碎敌人阴谋，保卫新生的共和国政权的故事。。
